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Image J 统计组化片子阳性信号的平均光密度值教程

神经病学医学生 · 最后编辑于 2023-10-09 · IP 广东广东
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这个帖子发布于 2 年零 144 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

本帖是关于组化片子如何用Image J 进行阳性信号的平均光密度值分析,关于如何用Image J 进行阳性信号面积占比分析见本人另一帖子(组化片子阳性面积占比统计分析(ImageJ)教程

1、       打开图片,将图片转换为8-bit格式:Image -> Type -> 8bit。

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2、       将灰度值转换为OD值: Analyze -> Calibrate Area -> Uncalibrate OD (滚动条拉到最底) -> OK。OD值单位为Intensity(a.u.)= Intensity arbitrayr unit,即任意单位。

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3、       设置测量参数: Analyze -> Set Measurements, 勾选Area,Integrated density,Limit to threshold。

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4、       选择阳性区域:Adjust -> Threshold -> Auto -> Set -> OK(红色代表选中,选择Limit to threshold只计算红色选择的面积)。

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5、       计算结果:Analyze -> Measure(快捷键Ctrl+M)。

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平均OD值为IntDen/Area,

所以本图片的平均OD值为: 34074.901/167018 = 0.204.


6、       导出结果:File -> Save as,结果为Excel格式。

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以上是今天的全部内容,祝各位实验顺利,早出成果,更多细节问题,可以在讨论区留言,但在讨论区回复可能不及时,若需及时回复,可以私聊,如果觉得有用,希望能留下你美好的点赞,也欢迎推荐给你身边的人,更欢迎转发朋友圈。

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