Image J 统计组化片子阳性信号的平均光密度值教程

本帖是关于组化片子如何用Image J 进行阳性信号的平均光密度值分析,关于如何用Image J 进行阳性信号面积占比分析见本人另一帖子(组化片子阳性面积占比统计分析(ImageJ)教程)
1、 打开图片,将图片转换为8-bit格式:Image -> Type -> 8bit。


2、 将灰度值转换为OD值: Analyze -> Calibrate Area -> Uncalibrate OD (滚动条拉到最底) -> OK。OD值单位为Intensity(a.u.)= Intensity arbitrayr unit,即任意单位。



3、 设置测量参数: Analyze -> Set Measurements, 勾选Area,Integrated density,Limit to threshold。


4、 选择阳性区域:Adjust -> Threshold -> Auto -> Set -> OK(红色代表选中,选择Limit to threshold只计算红色选择的面积)。


5、 计算结果:Analyze -> Measure(快捷键Ctrl+M)。

平均OD值为IntDen/Area,
所以本图片的平均OD值为: 34074.901/167018 = 0.204.
6、 导出结果:File -> Save as,结果为Excel格式。

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