组化片子阳性面积占比统计分析（ImageJ）教程
yj1984ren 推荐本帖是关于组化片子如何用Image J 进行阳性信号面积占比分析，关于如何用Image J 进行阳性信号平均光密度值分析见本人另一帖子（Image J 统计组化片子阳性信号的平均光密度值教程）。
第一步：导入图片：打开Image J，File→Open：打开要测量的图片（或者直接将图片拖至软件窗口）
第二步：转换图片格式：Image→Type→RGB Stack
此时，图片下端出现滚动条，左中右档分别对应红（red）、绿（green）、蓝（blue），选择跟阳性信号匹配度最高的图片用于后续分析，这里我选择blue档。
第三步：对染色区域进行标记：Image→Adjust→Threshold
出现Threshold界面，依次点击Auto和Set。
然后点击OK确认。
第四步：设置测量参数：Analyze→Set Measurements
在弹出的测量参数设置选项框中，勾选需要的测量参数：Area（所框选区域面积）；Mean（框选区域平均灰度值）；IntDen（Integrated Density）（框选区域荧光总强度）；Area fraction（面积占比），Mean gray value（平均灰度值），Limited to threshold（限于设定阈值），Display label（显示图片名称），点击OK确认。
第五步：测量参数：Analyze→Measure
本图片的阳性面积占比为24.626%。
第六步：保存结果：File→Save As
导出的数据格式是Excel表格形式的。
以上是今天的全部内容，祝各位实验顺利，早出成果，更多细节问题，可以在讨论区留言，但在讨论区回复可能不及时，若需及时回复，可以私聊，如果觉得有用，希望能留下你美好的点赞，也欢迎推荐给你身边的人，更欢迎转发朋友圈。
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