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[求助]为什么评分很高的引物也和引物原则不一致

最后编辑于 2022-10-09 · IP 陕西陕西
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这个帖子发布于 19 年零 203 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
我用primer 5自动搜索了一对引物,上游: 5’ tga aca ccg ctc cca taa 3'
下游: 5'ggc tgt gcc att ccc taa ,评价结果如下
rating length Tm gc% activity degeneracy Ta opt
上游 100 18 54.9 50.0 32.0 1 --
下游 100 18 56.3 55.6 33.8 1 --
产物 98 999 99.6 47.4 -- -- 53.4
引物评分很高,但是两个引物3‘末端都是A,而引物原则讲最好是C或G,A容易引起碱基错配;而且,引物原则讲Tm值在72度反应条件最佳,而这对引物都在55度左右。不知道我说的有没有道理,请各位大侠赐教,小妹不胜感激 。另外请教一下,后面那三项是什么意思,有何意义。





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