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PCR 基因全长克隆不出来怎么办

发布于 2020-10-13 · 浏览 3369 · 来自 Android · IP 海南海南
这个帖子发布于 4 年零 202 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

1.目的基因全长序列是通过深度测序得到的,全长2760bp,从ATG开始到TGA结尾,蛋白序列翻译也很完整

2.上下游引物是直接从头尾设计的各20bp,Tm值60,但是用DNAMAN看了一下,两条引物的5'端都有大概6个碱基组成的环

3. 现在这条基因一直扩不出来,尝试过温度T,换了许多次模板(用其它基因的引物验证过模板没有问题),也用诺唯赞 takara 生工的Taq酶进行尝试过都没有条带。但是有一次用takara的酶扩出了400bp的条带(确定不是因为污染产生的)。

4. 做过巢式PCR,从上下游各100bp内的非编码区设计了引物,扩出的序列4000多,完全不对。

5. 也找了其它同学帮我做过,仍然是没有条带。

求教各位老师同学们,还有没有其它方法可以尝试,或者其它设计引物的方法(我导师说全长引物最好从头尾设计,这样的话如果设计更长的引物也避不开5’端的环)。这个基因对我真的很重要,后面的实验全靠它了~~,还请有经验的盆友帮忙回答一下,不胜感激!!

最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 3369

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