BSP讨论交流

1.启动子序列:UCSC和NCBI都可以 NCBI更容易 直接输基因查找序列 看正反义编码 GeneBank 正的话从头序列到加两千 View获取就行 反的话 把尾序列号贴到头序列 尾序列换成加两千 View获取

2.引物设计:常规软件就好 1.BSP引物:MethPrimer现在设计出来的引物基本都挺好用 尽量做别人没做过的 包涵的CpG位点多一两个少一两个并不重要 只要条带够亮

3.引物CpG岛:谁说没有CpG岛不能做BSP?个人认为只要包含CpG位点就可以尝试 因为少有人做 说不定就有你想要的好的结果 但是 确实不好做 看个人 可以做辅

4.切胶:有二聚体也没事只要目的很亮 只切目的

5.测序前菌液PCR鉴定。

6.测序序列比对:QUMA就行 比的是设计引物用的启动子原始序列 不是全长 不然很难出结果

7.测序序列被排除:改条件 有时测的不一定准 大体上没毛病就能用 把限制条件降低些就行

8.测序给两条结果:自己用DNAMAN解决拼接，有时第一次只测出R或F，第二次测出另一条，可以联系公司拼，也可以自己下个DNAMAN拼

9.测序结果:结果能不能用可以先用genious看下。有除了C变T其他一致序列，且长度和产物片段大小一致的话即可。

10.紫外:板照了会儿紫外没关系，菌液照了会紫外没关系，紫外照多了没关系，实验继续做起来👻

11.管重复利用没关系，里面有水雾没关系，只要灭菌了就行，超净台里酒精灯点起来，实验必成功

12.其他的暂时想不起来了😁可以讨论～