菌液PCR和菌落PCR的区别

菌落PCR：不用提取基因组DNA，而是直接以菌体热解后暴露的DNA直接为模板进行PCR扩增，所用的引物建议使用载体上的通用引物。/通常利用此方法进行重组体的筛选或者DNA测序分析。

菌液PcR进行重组克隆的快速筛选：基本方法是从抗性平板上挑取单菌落接种至250 μL的LB培养基中，200r/min 振荡培养8h 以后，取1μL菌液进行裂解制备模板进行PCR筛选。

其实从根本上说菌液PCR应该含有的杂质更多一些，而且其中各种不稳定的因素很多，不管是菌落PCR或是菌液PCR，他们本身也受到了PCR的条件的影响，所以最根本的标准还是以酶切为主，但是有的时候酶切会遇到甲基话或是比例的问题，那么测序应该是最好的方法了。

但是，两者比较的话。个人觉得用菌液PCR比较好，在菌液摇床的时候大部分的表面附着的质粒会脱落，假阳性机会比较低，在用菌液PCR前最好预处理，这样会得到更多基因组DNA，pcr的效果也会比较好。

以下是预处理方法：1.取100uL培养液，1000rpm离心5min，弃上清收集菌体，加20uLTE或灭菌高纯水，将菌体吹打均匀，沸水浴5min后作为菌液PCR模板

2.用灭菌后的牙签轻轻粘取菌落，在准备好的双蒸水中（10ul）洗涮一下，盖好tube，PCR仪99度变性10分钟，冰上急冷，加入配置好的PCR混合液（总体积25ul），进行PCR反应就可以了。