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chip 实验中背景太高,IgG富集的和目的抗体量差不多……

发布于 2018-12-26 · 浏览 3207 · IP 上海上海
这个帖子发布于 6 年零 145 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

我用的是小鼠的成纤维细胞,用病毒感染后,最好定量为1.25E05/CHip反应。

甲醛封闭,甘氨酸终止。超声到500bp左右。

先用没加抗体的beads pre cleaning,上清和目的抗体过夜,第二天再用封闭的beads沉淀。

wash 按低盐、高盐、licl的次序各洗了两遍,每次10min.

但我最后的产物用qPCR检测都很奇怪。

input的cycle 大概是12左右,IgG 富集的很高,跟 RNAPii差不多

比如   GAPDH input 22   IgG26  RNAPii 28

         病毒基因GB INPUT 17  IgG18 RNAP II 18

之前做出来过,所以怀疑是buffer的问题,重配了几次都不管用,请教各位大神,大概是哪个环节出了问题呢?

IgG 用的是millipore兔抗, RNAPII 用的是stanta cruze 的

最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 3207

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