大家好,我刚做qpcr,发现阴性对照ct值总是很高,一般在16到24之间起来
如题,我是一名刚做pcr的小白,这个问题困扰我多久了,可能叙述会很啰嗦。
我的模板很短,只有30多个bp(Tm70℃),因此我设计的引物也很短,一个11bp,一个15bp,两个引物Tm值40℃左右,(我看网上设计引物的网站或者软件都不能用,因此自己根据大概的原则设计了一下),引物定回来后先做了普通pcr,琼脂糖凝胶跑胶后发现位置差不多于是就拿这对引物用了。
做qpcr是用的sybergreen法,我按照说明书配置的体系,退火温度50℃(一开始设置的35℃,后来感觉溶解曲线很乱,就做了个温度梯度),40个循环,我将模板进行梯度稀释(模板原液是10uM),然后结果发现从稀释到10万倍开始曲线ct值就没差别了,也和阴性对照没有差别。阴性对照ct值总是在16到24之间起来,重复了几次都没法消除,感觉像是污染了,于是换了试剂,换了实验室再次做还是这个结果,楼主作为一个刚刚开始做实验的新手简直要抓狂了,求助啊,现在很迷茫,不知道该怎么做下去。如图是最新一次的扩增和溶解曲线。