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【原创】针对外显子设计PCR测序引物教程

发布于 2009-06-06 · 浏览 1.6 万 · IP 德国德国
这个帖子发布于 15 年零 355 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
在园子搜索后,没有看到长基因(大与1000base)最简洁方法,而我现在欧洲实验室里从事这方面工作,作了大量这方面的工作。自乐不如同乐,愿将我们设计引物技巧与大家分享,敲字很辛苦,请斑竹给点分。
可能有战友说了,我们的长基因都是交给测序公司用鸟枪法来测全基因的。当然,您有钱当然可以这样做。我们的方法适用于基因测序筛查突变,步骤相对简便,比较经济。另外,本实验室最近的一偏文章采用该法发在了NEMJ上,可见该法已经是经典成熟的。
(1)基础知识
我们知道gDNA由非编码区,外显子,内含子构成。我们关心的基因是否突变在非编码区,外显字以及临近外显子的一小段内含子上。至于其他的内含子(gDNA中的大头),发生突变与否并不是我们关心的,其临床意义也相当小。因此我们只要设计引物来PCR上面三个重点区域就可以了。
(2)设计软件
在线设计软件 exon primer
http://ihg2.helmholtz-muenchen.de/ihg/ExonPrimer.html
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最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 1.6 万

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