【求助】请教关于IRES连接两个基因共表达的问题

我打算将两个基因通过IRES序列连接起来（A－IRES－B），达到双基因共表达的目的。打算将A,IRES,B依次放入腺病毒穿梭载体中，目前有这么一个疑问:在基因A已经装入载体后，继续装入IRES和基因B时，需要不需要对读码框？A和IRES之间由于酶切位点的不同，会留下一些碱基，这会不会影响表达。同样IRES和基因B之间由于酶切位点造成有一些多余的碱基会不会影响基因B的表达？
目前正在把基因往载体里装，但仍担心能否正确表达 。请高手不吝赐教！