【求助】PCR扩增与预期的大小相同,克隆测序包含两段引物,但是!
我用昆虫线粒体DNA的保守引物进行PCR扩增,扩增得到的目的片段大小与预期的大小相同,而且进行克隆测序,序列结果包含两端引物,但是将结果进行blastn却发现并非目的片段,谁能给解释一下是什么原因?如果是非特异性扩增,可两端引物都有,而且序列结果中引物序列没有变化。那扩出来到底是什么东西呢?blastn结果都是一些同源性很低的小片段。
p.s.:PCR扩增条带非常单一,当时考虑到需要精确的两端序列,选择了克隆测序。
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