【求助】关于r DNA的问题
这个帖子发布于 18 年零 225 天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
我想要通过pcr得到一段r DNA序列以构建超表达载体用，模板是酿酒酵母基因组，引物想要参考文献里提供的，已经引入酶切位点，
5rDNA ：GAT CGG ATC CCA TGA GAG TAG CAA ACG TAA GTC
3rDNA： GAT CGG CGC CTC AGG TTC CAC CAA ACA GAT AC
为了确保引物可行，我想确定一下引物配对的序列，进而确定最终的产物范围。我得做法是：
将酶切位点先去掉，用blast中的Search for short, nearly exact matches，把上下游引物输入进去，中间打回车隔开，我本来是想鉴定一下这对引物如何，但是搜寻结果却没有一个理想的，我又用oligo去看引物如何，输入的模板是blast中搜到的一些相关模板序列，可是均找不到能与上下游引物配对的位点。
我不知道我的做法是否合理，还请各位高手指点，我的目的就是要确定一下这对引物是否可行，另外，还想问一下如何在已经有的资源库里查找酿酒酵母r DNA序列。
5rDNA ：GAT CGG ATC CCA TGA GAG TAG CAA ACG TAA GTC
3rDNA： GAT CGG CGC CTC AGG TTC CAC CAA ACA GAT AC
为了确保引物可行，我想确定一下引物配对的序列，进而确定最终的产物范围。我得做法是：
将酶切位点先去掉，用blast中的Search for short, nearly exact matches，把上下游引物输入进去，中间打回车隔开，我本来是想鉴定一下这对引物如何，但是搜寻结果却没有一个理想的，我又用oligo去看引物如何，输入的模板是blast中搜到的一些相关模板序列，可是均找不到能与上下游引物配对的位点。
我不知道我的做法是否合理，还请各位高手指点，我的目的就是要确定一下这对引物是否可行，另外，还想问一下如何在已经有的资源库里查找酿酒酵母r DNA序列。
回复收藏点赞
