[求助]怎样找用于引物设计的mRNA全序列?

各位前辈大家好，本人想设计几个基因的RT-PCR引物，因为不是搞生化的所以有些基本问题没弄清楚，向各位专家们请教一下：
第一、用于引物设计用的mRNA是否一定要该目的基因的mRNA全长序列?我在NCBI中找到的mRNA有些只说明是那个因子的mRNA，有些还标明complete CDS，但往往那些标有complete CDS的反而更短，且没有多聚腺苷酸尾，还有那些没标到complete CDS的mRNA也长度不一，我想知道究竟那个才是可用于引物设计的mRNA?
第二、可能这个问题是引物设计的原则问题，但我查了好些资料都没找到相关介绍。引物设计时上下游引物是否都要设地密码子区（Codon）或都在非密码子区，因为有些因子的mRNA虽然很长，但密码子区却很短，如果一定要在密码子区设引物的话恐怕不易，不知是否可以一条引物设地密码子区，另外一条就设在非密码子区，以上的做法有什么区别吗？希望那位热心的园友帮一下忙，先谢过了。