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还在为KO细胞总有目的蛋白残留而苦恼?RNA Splicer工具来帮忙!

发布于 2023-11-28 · 浏览 543 · IP 广东广东
这个帖子发布于 1 年零 165 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

KO细胞在疾病基础研究和药物开发中应用广泛,但可能由于sgRNA切割效率过低、存在混杂细胞等原因,导致难以筛选出单克隆纯合子;即使测序鉴定为纯合子,WB检测环节仍时常发现有蛋白残留现象。别让这样的困扰再成为你科研路上的绊脚石,快来了解一下这个省时省心的RNA剪接模型工具吧!

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AI辅助筛选Western Blot阴性单克隆

借助罕见病数据中心(RDDC)开发的RNA剪接模型工具,预测碱基序列突变后mRNA序列可能发生的剪切情况,辅助筛选ORF移码的单克隆,更好地规避在Western Blot环节检测出蛋白残留的风险。



➢应用案例

(1)RDDC分析目标克隆在gRNA位点插入4bp后产生选择性剪切识别位点,形成新的截短转录本,Western Blot检测到截短的蛋白,与RDDC预测结果一致。


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(2)RDDC分析目标克隆在gRNA位点插入1bp未产生选择性剪切识别位点,产生移码突变和提前终止,Western Blot检测蛋白为阴性,与RDDC预测结果一致。


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除此之外,我们还可以借助Smart-CRISPR™细胞基因编辑系统,用户只需在系统中输入需要敲除的基因信息,即可得到自动化生成的方案设计,轻松实现基因敲除、基因敲入等多种策略,编辑效率高达90%

最后编辑于 2023-11-28 · 浏览 543

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