小片段连接构建载体一直连不上
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我是合成的两条单链,打算用同源重组的方式构建到载体上,两条单链中的一条链是由所要连接的载体同源壁15bp➕酶切位点➕我要连接到载体上的小片段40bp,另一条链同理,两条单链以引物的形式收到,后面我直接将两条链稀释后各加一些组成20μ体系去pcr用相应的退火程序退火,产物直接与双酶切回收纯化后的载体用重组酶连接,因为小片段的原因,鉴定我也设计了这个小片段上面的引物,但是由于小片段是串联序列的原因,菌落鉴定时特异性不好,但是用载体通用引物上游和片段上的引物下游,可以p出条带,大概五六条条带,目的位置也有,就去送测序了,结果就是小片段不存在,接着我检查是不是空载,结果也不是,连上去了一些乱七八糟的序列,是不是我的退火程序有问题,应该加退火缓冲液,亦或是连接过程的问题?希望各位大神帮忙指点一下,这个弄了俩月了附上一张鉴定图

最后编辑于 2023-04-06 · 浏览 1355