生信文献102.​免疫治疗靶点CD47的生信分析，这本院士做评委的7分+Frontiers子刊可投

由于生信论文思路和期刊更新迭代较快，在生信论文百篇基础上，结合一年内发表的论文，我们将从生信技能、生信思路和期刊选择角度，实战分析生信策略。同时，我们将更注重R语言实操（R语言实战和统计作图）和前沿进展的分享（文献分享和综述翻译）。愿与果友们一起学习，共同进步！

此外，我们将对免疫浸润12讲的内容进行升级优化。以肿瘤学权威教材《癌生物学》为蓝本，结合免疫学、病理学、遗传血、细胞生物学多学科交叉和前沿文献等，并将在线数据库融入到分享中，以推文、PPT、PDF版本和视频讲解等多种形式分享新的主题课程《肿瘤免疫 · 实操课程——可以操作的肿瘤免疫学》。请大家继续给与支持和关注！

生信文献102。我们分享2021年12月在Frontiers in Immunology发表的纯生信论文Significance of CD47 and Its Association With Tumor Immune Microenvironment Heterogeneity in Ovarian Cancer，讲述CD47与肿瘤预后相关的细胞功能行为和免疫稳态中的重要作用，分析CD47影响肿瘤免疫微环境及其对卵巢癌异质性的贡献。确定CD47可以作为一种预后生物标志物，并解释卵巢癌肿瘤免疫微环境的异质性。

这篇2021年底刚发表的论文如何逆袭，在纯生信已经强弩之末的背景下，强势发表。或许答案就在Methods的介绍之中！作者除了使用大家常用的数据库做各种分析之外，还借助热门技术——单细胞测序——公共数据库的资源，使得文章数据更可靠，没有任何实施的验证。还想发表纯生信论文的小伙伴，可以参考这篇论文。

文章整体分析不难，思路也跟我们分享的类似。

CancerSEA单细胞数据库的使用。说实话，相关系数挺小的。芒果也使用该数据库做过不少分析，总觉得相关性太弱了，所以没有使用。看来只要有相关性就行。这个数据库把很多表型列在数据库中，非常方面用来相关分析。

差异分析，单基因在特定肿瘤的表达。图1是单基因的泛癌分析！

生存分析

单细胞水平的差异分析

免疫浸润分析

富集分析

芒果之见：Frontiers in Immunology由美国国家过敏和传染病研究所 (NIAID) 的Luigi Daniele Notarangelo任总编辑。我国免疫学院士董晨也是编辑，目前影响因子7.561，实时影响因子7.741。该期刊以免疫为主题，但实际上接收的论文主题非常广泛，未来也有很大的上升空间。投稿难度挺大！

目前已经有果友的生信论文已经在投稿，有的还在写作。当有果友说，连续投稿3+期刊都被拒稿的时候，芒果表示同情。但是，我还是想说依据，多数情况下，不是期刊的编辑们不识货，而是我们的作品不够好！

要么没有原创性或创新性的视角；要么没有较为深入的分析；要么没有旗帜鲜明地提出问题，明确地解决问题。我们在公众号里面总结的套路，只是一种参考，一种思路，但并不是“标准答案”，因为生信分析是没有标准答案的。这篇论文就给我们提供了充分的证明，生信论文，贵在变化，贵在人无我有！

虽然国家一直在出各种文件，破除“唯论文”现象。但是芒果认为，科研思维和论文在未来的临床中只会越来越重要，“戏份”也会越来越多，这是医学科学发展的必然趋势，与国家政策无关。因此，芒果一直提倡医生们做生信科研，学好生信技能，发表生信论文；当然病例报道、临床研究什么的也可以发表，鼓励和支持。一起学习，共同成长，加油！