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生信论文93.Frontiers子刊,要求湿实验

发布于 2021-08-10 · 浏览 1678 · IP 上海上海
这个帖子发布于 3 年零 264 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
  1. 差异表达 (differential expression) +湿实验验证;
  2. 生存分析 (survial analysis);
  3. 相关分析 (correlation analysis);
  4. 统计分析 (statistical analysis);
  5. 组学分析 (genomic alterations);
  6. 免疫分析 (tumor infiltration analysis);
  7. 富集分析(enrichment analysis);
  8. 体外实验(in vitro experiments)+湿实验验证。


芒果一直觉得Frontiers众多子刊都是生信投稿的首选。尽管不接收单纯生信的文章,但是对于湿实验验证的生信论文,期刊还是相对友好的。在获得新的影响因子后,Frontiers in Oncology对湿实验的要求势必更加严格,这是大势所趋,其它期刊也可能逐步做同样的要求。接下来,芒果介绍另外一个Frontiers子刊——Frontiers in Molecular Biosciences。该期刊目前已经要求湿实验验证了。


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Frontiers in Molecular Biosciences will consider new testable hypotheses to inspire different perspectives and stimulate scientific dialogue. The integration of in silico, in vitro, and in vivo approaches will benefit endeavors across all domains of the life sciences.

第93篇生信论文。

该论文2021年5月24日发表在Frontiers in Molecular Biosciences上,题目: KIF18B is a Prognostic Biomarker and Correlates with Immune Infiltrates in Pan-Cancer。论文以差异表达展示入手,然后进行统计分析、生存分析验证和富集分析等。

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首先,作者通过用TCGA、GTEx和CCLE数据库展示KIF18B基因在不同组织、器官的表达情况,非常形象。我们一直在强调表达差异。我们研究一个基因,对于其在正常组织和肿瘤组织的表达必须非常清晰(Fig1),直观地展示基因在肿瘤和正常组织的表达差异。


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然后,作者用森林图展示风险比,属于统计分析,是对差异表达预后价值的统计确认,必须有,芒果曾分享其相关理论。

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后续的生存分析、相关分析都属于常规操作,芒果都已经分享过。

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该生信论文的免疫相关分析算是一个亮点,芒果曾经做过分享。

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整体来说,文章逻辑上比较明确,免疫浸润相关结果的展示,值得借鉴!

一起成长,共同进步,愿果友们多发论文。

最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 1678

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