dxy logo
首页丁香园病例库全部版块
搜索
登录

lncRNA设计引物,RT, qPCR相关问题。

最后编辑于 2022-10-09 · IP 北京北京
1.9 万 浏览
这个帖子发布于 9 年零 1 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

本人最近通过高通量测序,筛选出了一些差异性lncRNA。可是遇到一些问题,请大家帮忙分析解决一下:

1. lncRNA设计引物时是否根据公司给的序列直接设计即可?因为lncRNA有异构体,怎样找到该lncRNA的异构体?设计引物是否应该选取该异构体共同的部分进行设计?

2.本人想用原来拿去测序的标本进行验证,但是原测序标本加trizol放至在负80度,现在提RNA基本降解,是否可以换取新的标本再做验证?

3.提取标本中RNA中DNA污染严重,大家都是怎么处理的?我看网上说DNaseI,过柱,螯合剂对RNA均有降解,请问大家用什么方法,什么条件去除RNA中DNA污染?提RNA什么样的质量做逆转录没有问题?

4.DNA污染去除不了,lncRNA引物又不能设计成跨外显子,怎样在做qRT-PCR时排除DNA污染对结果的干扰?

5.qRT-PCR时,人的标本大家都选什么做内参。

6.大家有什么推荐的预测lncRNA及其靶基因mRNA、microRNA的网站吗?

急盼大家回复,小女子感激不尽,谢谢。

43 92 4

全部讨论(0)

默认最新
avatar
43
分享帖子
share-weibo分享到微博
share-weibo分享到微信
认证
返回顶部