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细菌V3区PCR扩增做不出来啊!急求!

发布于 2016-05-11 · 浏览 620 · IP 江苏江苏
这个帖子发布于 9 年零 27 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

做的是菌群结构分析,需要扩增细菌16s rDNA 做了2个月都没有什么结果,毕业论文来不及了啊,急求!

之前用相同的DNA模板做16S全长的扩增可以用目标条带,但是V3区的就是怎么都做不出来。

有没有用相同引物的能告诉我你们用的体系和条件啊啊!跪谢了!


下面是我用的引物 体系 和条件。

引物:357F-GC/518R

357F-GC:

5’-CGCCCGCCGCGCGCGGCGGGCGGGGCGGGGGCACGGGGGGCCTACGGGAGGCAGCAG-3’;

518R

img
:5’-ATTACCGCGGCTGCTGG-3’。

反应体系:采用25μL PCR体系:TaKaRa Taq (5 units/μL) 0.25μL,10×Buffer(Mg2+ free) 2.5μL,dNTPs 2μL,MgCl2 (25 mM) 1.5μL,模板DNA 2μL,上下游引物各0.5μL,无菌双蒸水15.75μL。

反应条件:94℃预变性4min;94℃变性1min,55℃退火50s,72℃延伸1min,扩增30个循环;最后72℃延伸10min。

PCR产物采用1.2%琼脂糖凝胶电泳检验。



最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 620

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