【求助】蛋白质组学怎么鉴定蛋白的不同修饰？

A蛋白在两种疾病中是高表达，我老板想用蛋白组学的方法鉴定出A蛋白在疾病中的差异。我打算用质谱去鉴定两种病中A蛋白修饰的不同。但是翻看了《蛋白质组学原理》一书，上面提到“每一种蛋白都存在数百种不同的修饰形式，由于修饰的多样性，这种设想实际上是不可行的”。哎，顿时迷茫了。

请教各位高人，鉴定蛋白的修饰理论可行不？需要什么样的条件和方法？谢谢！