介绍第3 款简单实用 PCR 引物设计软件
No.3 Primerbank
该数据库是哈佛大学的一个 qPCR 引物数据库,目前有超过 20 万条引物,涵盖了人和小鼠大部分已知的基因,且其引物有效率为 82.7%。
1、点击该网址:http://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/,进入搜索界面。搜索类型这里,可以根据 GenBank accession、NCBI protein accession、NCBI gene ID、primerbank ID、NCBI gene symbol 以及 keyword 六个选项进行搜索。

2、以小鼠的 beta-actin 为例。首先到 NCBI 上找出β-actin 的 gene ID,如图,选择 gene,输入beta-actin,并点击 Results by taxon 中的 Mus musculus,可得到以下结果。


小鼠 beta-actin 的 NCBI gene ID 是 11461,而 actb 则是小鼠 beta-actin 的 NCBI gene symbol。
3、将 Gene ID:11461 输入到 primerbank 点击 submit,可得到以下结果。


4、往下拉动滚动条,还可看到经过验证的引物,点击 Validation Results,即可看到溶解曲线、电泳结果等信息。


下一期 教你们PCR操作中必知的6大细节,让PCR的结果更加满意
最后编辑于 2024-04-13 · 浏览 1164