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质谱技术来抓菌?受不了,太快了

发布于 2020-12-17 · 浏览 1959 · IP 上海上海
这个帖子发布于 4 年零 137 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

以下摘自检验医学

“某”案例:


患者某,男,36岁,于11月2日到本院脑外科就诊头颅脓肿,发热待查,小赵医生对其进行切开排脓手术,体温仍不能下降至正常。医生考虑为细菌性感染,取伤口分泌物并立即送至检验科微生物室进行检验。


在此期间,小赵医生多次与检验科沟通,得到的回复是“等”!


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家属来咨询用药情况,小赵医生无奈地说:我也在等待药敏结果!

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经过一天的等待,小赵医生接到了检验科的电话:

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经验用药没有达到预期效果,小赵医生无助地再次咨询药敏结果...


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然而,患者病情在逐渐的恶化......这在某种意义上,是整个检验行业的一种悲哀。

临床微生物学检验的目的,是为临床提供及时、准确的病原体检验证据和指导感染性疾病的诊治。细菌的鉴定方法包括血清学鉴定、生化鉴定、全自动鉴定仪、核酸检测、质谱技术等。


细菌鉴定是细菌分类的实验过程,目前使用的传统方法虽然实现了自动化,满足了临床的部分需求,但仍存在着一些缺点,如检测时间长,检测结果不够精确等问题。


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这时,质谱仪的出现,就大大加快了细菌鉴定的进程!


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“质谱”,就是把化合物分子用一定的方式裂解后生成各种离子,按其质量大小排列而形成的图谱,通俗的来说,质谱仪就是一个离子质荷的一个天平。


MALDI-TOFMS基质辅助激光解析电离飞行质谱仪是由进样系统、离子源、质量分析器、离子检测器几部分组成,进入数据处理系统从而形成谱图。


鉴定依据为菌体内高丰富、持续表达蛋白(核糖体蛋白)的质谱指纹图及其重现性,数据处理系统相当于菌种的大数据库,对于检测的样本可以在数秒钟匹配数据库中的细菌图谱。


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操作流程简单,快速,有多快?


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有多简便?


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质谱的鉴定结果以分数的形式表示,分数为0-10分。

(得分区间为[9.5,10.0]):则该匹配结果种水平可信,可能的亚种;

(得分区间为[9.0,9.5]):则该匹配结果种水平可信;

(得分区间为[6.0,9.0]):则该匹配结果属水平可信,种水平参考;

(得分区间为[0.0,6.0]):则该匹配结果不可信,仅供参考。


1.真高分值:

细菌鉴定得分在9.0以上,丝状真菌得分在6.0以上,且鉴定结果明细较一致。


2.假高分值:

菌株鉴定得分较高,但鉴定结果明细一致性较低,主要由于有些菌株蛋白指纹图谱特征峰非常相似,从而无法区分的菌株,如大肠与志贺、阴沟肠杆菌与阿氏肠杆菌等,用户可根据有无临床意义判断是否有必要用补充实验做进一步验证。


3.假低分值:

细菌得分区间在9.0以下,丝状真菌得分区间6.0以下,如一些难破壁菌株,丝状真菌、革兰阳性杆菌等,鉴定结果明细里10个结果一致性较高,则种/属水平可信。


4.真低分值:

原因可能有混合菌、蛋白图谱特征峰缺失或峰数量过多或过少,造成谱图峰与标准库中谱图多种菌匹配;或数据库中没有收录该菌,一般鉴定结果为,少数菌可能由于与其他近似菌匹配。


质谱仪其他优势:


提高各种菌群的鉴定能力,提高厌氧菌的鉴定能力、提高苛养菌的检出率、提高不典型菌、丝状真菌、奴卡菌、分枝杆菌的鉴定能力等,在细菌耐药性检测中也具有很强的指导作用,MIRSA鉴别及分型、VRE鉴别及分型、ESBL检测、碳青霉烯酶检测、多粘菌素耐药检测、利奈唑胺耐药检测等。


质谱仪的劣势:


对于亲缘性较近、蛋白指纹图谱相似的菌株,通过质谱学方法较难区分。


需血清学验证的菌种 需进一步确认菌种

大肠埃希氏菌O157 烟曲霉

肠沙门菌亚利桑那亚种 大肠埃希氏菌

沙门菌群

志贺菌群 /




  

大肠埃希菌与志贺菌



链球菌属:肺炎链球菌、缓症链球菌、副血链球菌、口腔链球菌。


阴沟肠杆菌属复合群:阴沟肠杆菌、阿氏肠杆菌、神户肠杆菌、路氏肠球菌。


巴斯德菌属:多杀巴斯德、口腔巴斯德。


“质谱”,对临床微生物实验室的最大贡献,其一是速度,平均1分钟完成1-2菌株鉴定。其二,是菌谱,>1000种(包含丝状真菌、厌氧菌、奴卡氏菌、分枝杆菌等等。)其三,就是成本低,包括时间成本和经济成本,甚至是许多重症感染患者救命的福音。


质谱仪的出现将会逐渐改变现有的诊断模式,其简便、快速、精确的优势必将得到临床及检验工作者的一致认可。


新的细菌及真菌鉴定模式的诞生,是多么令人兴奋的消息啊!

最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 1959

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