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#筛选专题#二、乳浊液PCR产物快速高效回收及浓缩--内含操作视频

发布于 2019-05-23 · 浏览 972 · IP 安徽安徽
这个帖子发布于 5 年零 354 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

 

筛选专题二

核酸适配体筛选中ePCR产物 快!速!高!效!回收!

 

        核酸适配体筛选中的乳浊液PCR(emulsion PCR)是利用油包水乳液体系中的微液滴作为反应器进行的PCR扩增体系。近年来乳浊液PCR在生物医学领域的应用越来越广,可以实现在每个微液滴中进行单分子模板的扩增反应,从而避免常规PCR扩增过程中出现的扩增偏好(PCR bias)问题,提升核酸适配体的筛选成功率{Yufa, 2015 #1282}。

        上一个专题我们已经说过乳浊液的制备方法:通常用振荡的方法即可得到乳浊液,虽然这样得到的油包水的液滴大小不一,但是对于核酸适配体筛选中的PCR步骤已经可以满足了。

        在我们的每一轮筛选实验中,使用乳浊液PCR进行扩增的时候,PCR mix和油的体积共约10ml,分装到PCR管进行扩增时大约需要96管,也就是12个八连排管!!ePCR的产品非常粘稠,容易挂壁,如果使用常规方法,用移液器一个个管子回收乳浊液到收集管中,需要至少15分钟,且很多都会残留在管壁,损失很大,如果想减少损失的量,用破乳的溶剂再去逐个清洗PCR管,然后回收溶液,时间又会增加至少一倍!收集乳浊液后进行破乳,浓缩单链,整个流程通常需要至少2小时。

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图1:核酸适配体筛选中e-pcr产物

 

        我们提供了一种通过离心快速收集乳浊液的方法,方便快捷,且损失量非常小。见视频。同时还提供了乳浊液的破乳以及用正丁醇快速浓缩的步骤,整个乳浊液收集→破乳→浓缩大约30分钟即可完成,节省了大量的时间,提高了筛选效率。筛选过程中的这些小窍门会将我们从繁琐、枯燥、简单的操作中解放出来,节省更多的时间和精力投入到更有价值的研究中。

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图2:回收的乳浊液

 

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图3:破乳浓缩后的e-pcr扩增产物--双链DNA

 

使用视频中提供的方法,

将乳浊液从12个八连排PCR管收集到离心管,

时间可从30分钟缩短到

3分钟

 

最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 972

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