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如何应用1000 Genomes project中Allele Frequency Calculator results计算MAF

老年病科医师 · 最后编辑于 2022-10-09 · IP 辽宁辽宁
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这个帖子发布于 7 年零 223 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

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CHR: Chromosome 

POS: Start position of the variant

ID: Identification of the variant 

REF: Reference allele 

ALT: Alternative allele

TOTAL_CNT: Total number of alleles in samples of the chosen population(s) 

ALT_CNT: Number of alternative alleles observed in samples of the chosen populations(s) 

FRQ: Ratio of ALT_CNT to TOTAL_CNT 

这个FRQ是MAF吗?

如果不是那应该怎么计算MAF呢?谢谢


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