【求助】有关载体构建

我的目的基因是构建在pcmv tag2b载体上的，但我还需要构建目的基因的氨基端和羧基端，而实验室没有pcmv tag2b空载，在丁香园上求助也无果，所以老板建议把目的基因切下来后再扩增即得pcmv tag2b空载，我有问题如下，希望能得到各位的帮助：
1 我的目的基因是构建在srf1 和EcoR1 上的，目前srf1内切酶我一直没有找到哪个公司出售，因此我想单用EcoR1酶切后，再在两端设计引物，在引物的5’端加上相同的酶切位点如ECoR1 ，PCR 后采用此酶酶切再自连，通过这种方法来构建空载不知是否可行。是否易于导致载体突变。
2 我要构建目的基因的氨基端和羧基端，也需要通过pcr构建（因没有找到合适的酶切位点），但设计引物时需要加上酶切位点，因模板和目的都采用相同的载体，因此设计的酶切位点就是模板载体本身所用的酶切位点，这种情况下设计的引物不知是否易于导致错配。
3 我还有一个方案就是将目的基因转到另一个载体上如pEGFP－N 1上，因此可能要进行三次PCR 扩增，而且在构建羧基端时，其上游引物可能比较长，不知道这种方案和前面一种方案哪一个更可行。