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【心得】如何查找SNP位点附近的序列

最后编辑于 2011-11-19 · IP 四川四川
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这个帖子发布于 13 年零 223 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
之前老板让设计SNP位点测序的引物,为了找到SNP位点周围的序列费了不少的劲。无意中发现一个很好的方法。今天把这个方法放到论坛里,也算是为自己学到一个新东西留个纪念。也不知道对各位有没有帮助,欢迎大家批评指正。
首先,我们进入NCBI搜索界面,在SNP数据库中输入SNP位点的rs编号。

img

点击搜索后来到以下界面

img

rs编号下的序列就是SNP位点的序列,中间红色标注的就是SNP位点。不过有时候这段序列是错误的,而且这段序列很短,不足以用于设计引物。






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