如何选择肠道菌群的研究手段(五)——代谢组学 【肠菌研究方法系列讲解】
(宏)代谢学组
代谢组学(metabolomics)是继基因组学和蛋白质组学之后发展起来的新兴的组学技术,是系统生物学的组成部分。宏代谢学组是特指环境微生物在特定时刻下所有的小分子代谢物,它们的分子量都在1500以内。
代谢组学的应用场景介绍:
医学上标志诊断物(biomerker)
药物靶点的发现 (代谢物KEGG通路)
农林上的营养价值评判、疾病诊断、生长环境检测
机理判断 (代谢流等)
宏代谢组学研究平台主要有2种:LC-MS和GC-MS,它们是根据待测物质的属性进行分类的如下图:
宏代谢组学的检测流程如下:样品采集(预处理)—代谢物提取—GC/LC-MS检测—定性(定量)分析。
这里需要提一下的是,肠道菌群的宏代谢组已经非常成熟,不仅常见的非靶代谢组学用于发现许多特异的肠菌代谢产物,更有开发了一些高通量靶标代谢组学产品。
篇幅有限,这里对检测结果就不进行分析说明了。
对非靶代谢组学的原理,流程后面会详细介绍,请关注此贴:
http://www.dxy.cn/bbs/topic/42311495
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对肠道菌群代谢组学做了一个系统梳理,关注此贴:
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肠菌研究方法到此就结束了,大家可回头把这些再读一下,以后在方法选择上就心中有数了。后面仍会继续解读肠道菌群方面的好文章,请继续支持!
最后编辑于 2019-12-07 · 浏览 1.2 万