我的临床血标本收集以及全血rna提取小总结
看了好多帖子也查了一些东西,简单整理了一下。
因为时间精力有限,不是每管血样都能及时提取rna,所以有一些公司设计了非冷冻全血rna保存液,我查到的比较靠谱的貌似只有qiagen的paxgene?其实是配套了BD特殊采血管(含专利保护rna的成分),可以保存很长时间(网上可以查到介绍),然后搭配qiagen的kit,价格昂贵,望而却步。还有的一家国产公司,貌似叫rnafix? 效果有待考证,没敢尝试。天*恩*泽有一款rnalocker保存全血效果不好,得把白细胞分离出来以后加入,然后还要离心去除,后续搭配trizol/该公司类似trizol的试剂盒。另外全血可能不适合直接加入rnalater或者trizol保存。新鲜全血用trizol也能提出来,但得率和纯度低于白细胞用trizol
我现在采集血样,只留一管紫管,EDTA抗凝血。一部分可以2500至3000rpm离心得血浆(不要贪心,注意别吸到中间的白细胞层,剩下的血细胞层理论还可以再用来提dna/rna)。一部分直接冷冻/冷藏留作dna。剩下的尽快提rna。正经的还是分离白细胞(红细胞裂解液)然后trizol提取(也可以在trizol里保存)。不推荐冷冻保存的全血提rna,易降解,得率低。(虽然rt一般只需要100ng-2ug)(有国产公司biog试剂盒号称可以提取冷冻全血rna,效果呵呵哒,园子里广告多,大家要小心)
提取出来的rna可以加入rna保护剂,负20或许能到半年之久。但还是尽快处理,避免反复冻融。
Rna质量初步判断:普通1%琼脂糖电泳,新的电泳液新的胶洗洗池子100-150v 15min 离加样孔由近及远的依次为28s、18s、5s。5s越亮说明降解的越多。另外,如果,28s是18s亮度约两倍的话,就可以进行下一步实验了。
最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 3995