【求助】反转录引物的正反向问题

我现在在用两步法做RNA病毒的转录。对于正链RNA病毒，我是使用下游引物作为逆转录引物。对于负链RNA病毒呢，是用下游引物还是上游引物作为逆转录引物呢？我的经验好象是都可以的！我有点想不过来了！是我们提取的模板同时含有正负链RNA吗？（虽然是单链RNA病毒，因为生命活动，正负链RNA同时存在？）
还有，对于单负链RNA病毒，NCBI上的基因序列是负链RNA的5‘到3’序列吗？