【求助】基因多态性与疾病相关研究

园子里的各位前辈们，本人要做某一基因的基因多态性与某疾病的相关研究课题，对SNP所知甚少，在园子里瞎游了一段时间，还是对此一头雾水。望各位前辈们指点迷津。。
老板给了我基本的试验步骤：1、针对该目的基因的所有外显子设计引物，进行pcr扩增；2、将扩增的样本量进行变性高效液相检测（DHPLC）；3、将异常峰型的样本进行基因测序后分析结果。
我的问题是：
1、这种设计可行么？这种设计能得出我要的结果么？DHPLC可检测出基因突变和SNP，而且通常还有新的位点发现，但如果我要分析对照组和疾病组异常等位基因频及两组之间的区别，又应该怎么分析？
2、DHPLC中检测纯合子变异型时，需要将野生型与样本混合后一起检测，请问怎样获得野生型？
3、关于样本量的问题，老板是要我做20个患者+20对照组，是不是太少了，这有什么要求么？
关于这个试验，还有很多不懂的问题，请各位前辈，好心人给我点意见，帮帮我吧！万分感谢！！！！