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【分享】NCBI dbSNP Genotype Server 批量下载Genotype。

最后编辑于 2022-10-09 · IP 山东山东
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这个帖子发布于 18 年零 146 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
NCBI dbSNP Genotype Server

说明:
NCBI 2006年8月29日发布的服务,可按照SNP的rs收录号、染色体上的起始位置、基因的名称,大批量的检索

Genotype,并且,返回的结果很人性化,界面很友好,可以有html、xml、text和haploview多种格式。

检索主界面:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/snp_gf.cgi

帮助说明:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/docGenotype.html

使用方法:
网页友好界面,用法很简单,一般有3步,step1、step2、step3按照其说明向下检索即可。
超过20000个Genotype的检索结果以xml形式发送至指定的email。

个人经验:
批量下载SNP数据不错,可直接导入Haploview很方便。再找感兴趣的位点的LD,或查找Haplotype,tSNP等。
img



















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