实验必备!一文读懂 loading buffer 的神奇功效
一、Loading buffer的组份及作用
1.6×loading buffer一般配置


Loading buffer是电泳实验中的一个关键试剂,其组分设计旨在保护样品并确保电泳过程的顺利进行。
2. 各组分的作用
① EDTA(乙二胺四乙酸):EDTA是一种常用的螯合剂,可结合多种金属离子,从而抑制核酸酶(如DNase和RNase)的活性,避免核酸降解,保护核酸完整性,进而提高实验的成功率。此外,EDTA通过螯合金属离子,防止其与带电核酸发生相互作用,这有助于避免电泳条带模糊或迁移速度异常。
② Glycerol(甘油):甘油具有高密度特性,能显著增加样品的密度,使其大于TAE或其他电泳缓冲液的密度。这确保了样品能够沉降入点样孔,而不漂浮在表面,从而防止样品扩散到凝胶孔外,造成条带模糊或样品丢失。
③ Xylene Cyanol FF(二甲苯青FF)和 Bromophenol Blue(溴酚蓝):这两种染料用于指示电泳过程的进展。通过观察这些染料的迁移速度,实验者可以适时监控并决定何时终止电泳,从而避免条带跑出凝胶范围,有助于获得明确的电泳结果。
④Xylene Cyanol FF(二甲苯青FF):作为一种常用的核酸电泳指示剂,二甲苯青FF在分子生物学实验中发挥着重要作用。其水溶液呈现鲜明的蓝色,在电泳过程中可在凝胶上形成清晰的蓝色条带,便于实验人员实时观察电泳进程。该指示剂的迁移速率与DNA片段大小具有显著相关性:在1%琼脂糖凝胶中,其迁移速率与2Kb的双链线性DNA相当;而在1.4%琼脂糖凝胶中,则与1.6Kb的双链线性DNA迁移速率相近。这种特性使其成为判断电泳进程和确定电泳终止时间的可靠指标。值得注意的是,二甲苯青FF的分子量较大(538.63 g/mol),因此在电泳过程中迁移相对较慢,特别适用于监测较大DNA片段的迁移情况。

⑤Bromophenol Blue(溴酚蓝):作为另一种常用的电泳指示剂,溴酚蓝在凝胶电泳中呈现明显的蓝紫色条带。其迁移特性与DNA片段大小密切相关,且在不同浓度的琼脂糖凝胶中表现出特定的迁移规律:在0.6%琼脂糖凝胶中,其迁移速率与1Kb的双链线性DNA相当;在1%琼脂糖凝胶中,与0.6Kb DNA片段相近;在1.4%琼脂糖凝胶中,与0.2Kb DNA片段相当;而在2%琼脂糖凝胶中,则与0.15Kb DNA片段的迁移速率相似。溴酚蓝的分子量较小(669.96 g/mol),因此在电泳过程中迁移较快,特别适用于监测较小DNA片段的迁移。在实际应用中,溴酚蓝和二甲苯青FF常常配合使用,以提供更全面的电泳进程指示。这两种指示剂的组合使用可以同时监测较大和较小DNA片段的迁移情况,为实验人员提供更准确的电泳进程判断依据。

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