肠道真菌可预测肿瘤免疫治疗疗效

肠道真菌可预测肿瘤免疫治疗疗效

作者：中国医学论坛报

 近日，上海交通大学医学院附属仁济医院消化科陈豪燕和洪洁团队在《细胞》杂志子刊《细胞·宿主与微生物》以推荐论文形式发表研究成果，首次揭示了肠道真菌谱具有预测肿瘤免疫治疗疗效的作用，且肠道真菌预测准确性更高。该研究为筛选肿瘤免疫治疗的应答者，从而提高免疫治疗的适用性提供了新思路。

研究整合了来自不同国家、不同肿瘤类型的使用免疫检查点抑制剂（ICB）治疗的9个宏基因组队列，同时计算了肠道真菌及细菌双界微生物组，发现了可用于预测ICB治疗应答的真菌及细菌标志物。团队通过构建随机森林模型，预测了癌症患者对ICB的应答反应。结果显示，肠道真菌具有良好的预测效能且其预测效能比细菌更高。此外，整合细菌及真菌双界标志物进行预测时会达到良好的预测效果。根据真菌标志物预测的应答者，肿瘤免疫微环境中有更多的耗竭性T细胞浸润，且该类患者的生存期优于不应答者。双界网络分析及微生物功能预测分析表明，真菌Schizosaccharomyces octosporus可能在应答者肠道中将淀粉发酵成短链脂肪酸，从而促进ICB治疗的应答。

研究首次揭示了肿瘤免疫检查点应答者及不应答者全面的泛癌肠道真菌谱，发现了具有良好预测性能的双界微生物标志物，突出了真菌在预测免疫治疗疗效方面的潜力，有望提高ICB治疗的适用性，为利用这些标志物预测ICB疗效、改善应答提供新思路。

仁济医院消化科博士研究生黄孝雯、博士研究生胡慕妮、主治医师孙甜甜，上海市胸科医院肿瘤科主治医师李剑涛和仁济医院消化科博士后周一芦为该论文的共同第一作者；仁济医院消化科陈豪燕研究员和洪洁研究员为该论文的共同通讯作者。本研究还得到了仁济医院消化科主任房静远教授的大力支持。

综合周刊2023年11月16日A2版.pdf