【求助】RNAi目的蛋白与小鼠蛋白mRNA高度同源怎么办？

向大家请教，我需要购建慢病毒介导的shRNA，将来可能会直接将病毒载体用于小鼠体内。可是需要干扰的目的蛋白与小鼠的同源蛋白mRNA序列几乎是90%以上的高度同源，这样的干扰慢病毒注入小鼠体内后会干扰小鼠蛋白的表达？设计片段是需要注意什么问题？谢谢大家！