基因芯片矩阵数据如何还原原始数据求差异倍数?
简单说目前遇到的GEO芯片 矩阵数据有三种。
一种是很多0或很多1
一种是通篇稳定在7-10左右
一种是大到几百上千,小到1点几都有
问题:在不用R语言的情况下(实在是不会)
1,怀疑这些数据有些是被标准化。但如何通过矩阵数据还原它的原始影响从而求差异倍数?(而非logFC)
2,这三种矩阵数据是否处理方式不同。如果是,分别应该如何处理呢?
3,geo2r的在线分析是否可以直接求差异倍数?(非log2后的)如何操作呢?
劳烦各位解惑了~一起讨论也很欢迎
最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 700