手牵手写个网药2

二、靶点标准化

在前面已经获取了香附的中药成分+靶点信息，接下来便是对靶点信息进行标准化。就像你在家叫小王，在村里叫狗蛋，朋友叫你狗剩，但没用，唯一被外面人所承认的是你掏出证件后的名字。靶点也是如此，命名众多，故需对此进行命名的标准化，转换为对应的gene symbol。

数据库：https://www.uniprot.org/

1.方法一：直接怼

打开uniprot官网，便可见一搜索框，把前面收集的诸多靶点分别输入，search，复制，粘贴，完成。

缺点：看网速，网速不好，半小时能搜完算快的了。

2.方法二：Vlookup函数

①点击Swiss-Pro

②分别选择Reviewed，Human。（经实验验证过的人类靶点信息）

③Download→Format：Excel→Uncompressed→Go（将实验验证过的人类靶点信息

统一下成未解压的excel格式，后续操作可不用通过uniprot官网，仅需在excel上操作即可，故对于网络不好的用户可选择该方法）

④excel文件处理：分别对Protein name列以“(”“[”进行分列；对“Gene name”列以空格分列；并通过TRIM（）函数去除分列后的前后空格。结果如图所示：

⑤Vlookup查找

通过Vlookup函数匹配靶点蛋白名搜索对应的基因名，如图：通过该方式可匹配出大多数gene symbol，但对于出现#N/A的靶点，可另自行输入uniprot官网单独查找。

三、疾病靶点查找

数据库GeneCards：https://www.genecards.org/，特点：直接导出，无需靶点标准化。

将疾病名直接输入即可：

symbol为靶点的基因名，此处已为标准化，无需另外转化；根据Score大小，筛选排名较前的靶点，视为该疾病的关系性较好的靶点。

点击export要求log in，注册一个账户即可。导出成excel格式。这时候，中药-疾病的靶点分别处理完成，接下来可对二者进行操作处理。