拷贝数变异（CNV）

人类基因组由23对染色体中的60亿个碱基（或核苷酸）组成。

正常人类基因组成分通常是以2个拷贝存在，分别来自父母。

拷贝数变异（CNV）是由基因组发生重排而导致的，一般指长度为1kb以上的基因组大片段的拷贝数增加或者减少，主要表现为亚显微水平的缺失和重复，是人类疾病的重要致病因素之一。

异常的DNA拷贝数变化（CNV）是许多人类疾病（如癌症、遗传性疾病、心血管疾病）的一种重要分子机制。作为疾病的一项生物标志，染色体水平的缺失、扩增等变化已成为许多疾病研究的热点，然而传统的方法（比如G显带，FISH，CGH等）存在操作繁琐，分辨率低等问题，难以提供变异区段的具体信息。

CNV，即拷贝数变异，一般指长度为1kb到几个Mb基因组大片段的拷贝数复制、缺失。

CNV被定义为一段至少1kb大小DNA的拷贝数，与具有代表性的参考基因组拷贝数不同。

CNV在基因组中的存在形式主要有以下几种：

2条同源染色体拷贝数同时出现缺失；

1条同源染色体发生缺失，1条正常；

1条同源染色体出现拷贝数重复，另1条正常；

1条同源染色体出现缺失，另1条出现拷贝数重复；

2条同源染色体同时出现拷贝数重复。

染色体拷贝数变异（CNV）检测：NIPT技术目前医院临床应用的为普通NIPT技术，商业上还有通过增加测序数据的升级版的NIPT产品（可以检测染色体微缺失/微重复和某些单基因病）。对于NIPT提示的CNV可以分为两种：母源性CNV，就是母亲存在CNV（此时胎儿50%可能存在相同的CNV，50%可能不存在该CNV）；第二种，胎儿CNV。

母源性CNV的阳性预测值（PPV）接近100%，因为母源游离DNA占比90%，因此阳性预测值（PPV）很高就不足为奇。但是不同的检测机构或者有些已发表文献，并不提示母源性CNV。对于母源性CNV，胎儿无非两种情况，和母亲一样拥有同样的CNV，或不含有该CNV。在临床咨询中，对于这种来源于母源或父源CNV，如果父母本身没有任何表型，胎儿本身也不存在超声结构异常，我们大多认为偏良性。遗传咨询时，医生会告知由于遗传的异质性，即使胎儿的CNV来自表型正常的父母，也不能代表胎儿一定没有表型，因为有很多具有相同CNV的家系成员表型可能从无表型到严重表型。此时可以通过介入性产前诊断，胎儿样本做染色体核型分析和染色体微整列分析（或CNV-seq），来明确诊断CNV的大小和胎儿的具体情况（注：这里讨论的CNV大多是指临床意义不明的，对于明确致病的CNV，相应的临床建议不同）。

胎儿CNV，CNV按照现有的标准分为致病性、可能致病性、临床意义不明、可能良性、良性。最难的咨询的也是临床最常见的是临床意义不明的CNV，对于NIPT提示的这种CNV存在较高的假阳性率（具体见下图大数据的NIPT(plus)的数据统计结果，对于常见的明确致病的DGS，PWS，22q dup综合征有较高的阳性预测值（PPV），>10MbCNV的阳性预测值（PPV）为31.9%，<10Mb的CNV阳性预测值（PPV）只有18.8%），因此一定要通过介入性产前诊断明确该CNV是否存在以及片段大小，有时还需验证夫妻双方已明确CNV的来源，如果胎儿CNV遗传自表型正常的父母，一般认为偏良性，对于新发的临床意义不明确的胎儿CNV，实际上很难咨询的，只能通过现有的数据库如decipher，OMIM，DGV等数据库以及胎儿的超声影像学综合评估，查询CNV包含的基因情况，是否存在单倍剂量不足或三倍剂量敏感，还要结合已有的病例报道，但最终的决定权还在夫妻双方，临床医生只能通过现有的资料和数据告知胎儿可能的预后情况。胎儿期的临床表型有限，只能通过超声影像评估胎儿结构方面的问题，对于出生的生长发育，智力情况无法预测。

对于无创提示CNV，一定不要轻易的决定胎儿的去留，一定要进行介入性产前诊断明确CNV来源和大小，对CNV致病性进行评估，通过密切结合胎儿仅有超声影像学资料综合评估，染色体CNV普遍存在于我们每个正常人，只是现有的知识和数据库资料有限，因此有很多临床不明的CNV难以解释，因此产前诊断还有很多的路要走，很多时候就算是经验丰富的临床医生也无法给出明确的临床建议。产前诊断工作如履薄冰，如临深渊，临床医生会尽最大可能给出相对准确的临床建议。

注：一定要听取自己的临床医生建议，以上信息为个人经验仅供参考，因为只有您的医生最了解您和胎儿的真实临床资料。

正常：2拷贝

缺失：1或0拷贝

重复：>2拷贝

CNV在人类基因组中分布广泛，是人类疾病的重要致病因素之一。致病性CNV可引起智力障碍、生长发育迟缓、自闭症、各种各样的出生缺陷、白血病和肿瘤等多种疾病。