EMSA竞争性条带为何比样品反应更强?
主要操作步骤
1. 探针的标记:
使用生工合成引物,在双链的5`端标记Biotin,后使用碧云天退火缓冲液退火形成双链。
2. EMSA胶的配制:8%非变性PAGE胶
3. EMSA结合反应:
(标记探针终浓度为5nM,未标记探针终浓度为1μM,使用的纯化转录因子蛋白,约5μg/μL)
a、阴性对照 Nuclease-Free Water 7
EMSA/Gel-Shift结合缓冲液(5X) 2
纯化的转录因子 0
标记好的探针 1
b、样品反应 Nuclease-Free Water 6
EMSA/Gel-Shift结合缓冲液(5X) 2
纯化的转录因子 1
标记好的探针 1
c、探针冷竞争 Nuclease-Free Water 5
EMSA/Gel-Shift结合缓冲液(5X) 2
纯化的转录因子 1
标记好的探针 1
未标记探针 1
加入探针前使反应体系室温放置10min,先加入竞争探针,室温放置20min,再加入Biotin标记探针,室温放置20min,加入1μL无色loading buffer,上样电泳。
4.电泳:
a.用0.5XTBE作为电泳液,100V,预电泳60min。
b.把混合了上样缓冲液的样品加入到上样孔内,100V电泳,将电泳槽置于冰浴中。电泳至蓝色染料溴酚蓝至胶的下缘1/3处,停止电泳。
5.转膜:
a.取一带正电尼龙膜,剪角做好标记,用0.5XTBE浸泡15min。
b.按照三明治法将胶和膜夹在一起,中间无气泡,采用Western电转膜装置,以0.5XTBE为转膜液,冰浴,380mA转膜45min。
c.转膜完毕后,取出尼龙膜,样品面向上,放置在一干燥的滤纸上,轻轻吸掉下表面明显的液体,保持上表面湿润
7.交联:254nm紫外灯,10cm距离,照射10min。
8.检测:封闭液封闭30min,加入含Streptavidin-HRP Conjugate(1:2000)的封闭液,摇床孵育30min,洗涤液洗涤5min * 4次,平衡液平衡5min,ECL显色。
具体实验结果
问题:
相比样品反应,为何竞争反应条带更强,就算没有竞争,但是条带更深有点不明白。
最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 5096