【求助】蛋白的质谱分析
我有一个蛋白,纯化之后出现两个条带,经western blot杂交,都可以杂上,而且可以肯定不是提前终止造成的,因为我两端都加标签纯化的
看到一篇文献,他们做的蛋白有类似现象。他们拿去做maldi-tof,根据两个条带的m/z差,软件推测其中大的一个可能是被糖基化的。最后他们进一步用液相色谱质谱联用,得到具体糖基化位置和糖基的结构。
我查了很多文献,都是说把某个蛋白先用胰蛋白酶切,再上质谱,得到指纹图谱。但我上一段里边讲到的文献貌似是将整个蛋白拿去做的质谱(大概16-17kd)。我是想问,到底可不可以将整个蛋白不经酶解拿去做质谱(maldi tof)呢?对大小是不是有限制呢?我的大概30kd左右。
大家可能会问我干嘛非要全长拿去做呢。我是想像刚才提到的文献那样,先看看二者m/z差别,看是否确实有糖基化存在。而蛋白的身份,我觉得western blot还是足够验证了。
不知道我的想法是否正确,请各位指教指教。。