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【求助】关于避免移码的tips

发布于 2006-12-20 · 浏览 1518 · IP 广东广东
这个帖子发布于 18 年零 158 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
今天在为双酶切设计引物,为了防止移码突变,一直小心翼翼的。我总结出几点体会,请大家看看对不对.嘻嘻~
如果上游引物引入ATG,下游引物引入stop codon,那们就可以不需要考虑移码,反正都是从ATG开始编码,到stop codon结束。
如果不引入ATG或者stop codon,那么就要看用的酶切的识别位点是几个碱基,如果识别6个,12个这样3的倍数,就不会移码。如果不是3的倍数,像4个碱基,8个碱基,就会移码了。
例如,某载体上的一段序列
----CTCGAGCACCACCACCACCACCACTGA-------
----------
其中CTCGAG是MCS的最后一段,是XhoI的识别位点,紧接着是6×HIS,然后是TGA stop codon。
如果下游引物就是利用XhoI酶切位点,那就不用考虑移码问题,保护碱基+CTCGAG+目的基因CDS的最后一段,就是下游引物了。
希望大家指正。嘿嘿。







最后编辑于 2022-10-09 · 浏览 1518

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