三个方法判断qPCR数据能不能用?
看完这篇,再也不怕被导师追着问“数据怎么又废了?”
一、扩增曲线:S型才是真命天子!
✅ 合格标准:
• 曲线像顺滑的滑雪道(S型),指数期陡峭,平台期平稳。
• 荧光值至少>3,无锯齿或二次抬头。
❌ 异常预警:
• 锯齿状:移液手抖/仪器信号不稳,用多通道移液器+检查仪器。
• 平台期过早:模板浓度过高(>100 ng/μL),稀释10倍再测!
• 无曲线:RNA降解/引物失效,换一批试剂重新提RNA。
二、阈值线:位置决定CT值命运!
✨ 设置秘诀:
• 默认选基线标准差的10倍,手动调整时要卡在指数期中间段(像切蛋糕切到奶油层)。
• 太高会漏掉低表达基因,太低易被背景干扰。
⚠️ 新手误区:别跟风调阈值!先看所有样本的曲线走势再决定。
三、CT值:15-35是安全区!
🔍 数值密码:
• 目标基因:15-35个循环(低表达基因可放宽到38,但需谨慎)。
• 内参基因(如GAPDH):18-28个循环,且不同样本间波动≤1个循环。
🚫 雷区警告:
• CT>35:信号太弱,加模板量或优化引物。
• CT<15:模板过量,稀释后重测!
四、内参基因:稳住数据的定海神针!
🔄 选择原则:
• 选稳定表达的看家基因(如β-actin、18S rRNA),避开应激相关基因。
• 所有样本的内参CT值CV<5%(技术重复),组间波动≤1个循环。
❓ Q&A:内参CT值飘了怎么办?
• 先查RNA质量(OD260/280=1.8-2.0),再检查反转录效率。
五、重复性:数据 reproducible 才是王道!
🔄 技术重复:
• 同一样本测3次,CT值差异≤0.5,定量结果CV<10%。
• 用**Excel公式=STDEV.P(CT值)**算标准差,>0.5就重做!
🔄 生物重复:
• 组内样本CT值分布集中,用GraphPad画箱线图,异常值(Z-score>2)直接剔除。
六、溶解曲线:单峰才是真·专一!
🔥 黄金标准:
• 熔解峰尖锐单一,Tm值75-90℃(比引物二聚体高5-10℃)。
• 无杂峰(二聚体峰在70-80℃,需优化引物



