求助!志贺氏菌相关实验
有大佬做过志贺氏菌嘛?我目前一直在敲除福氏志贺氏菌(2a)毒力大质粒中的mxi基因,破坏T3SS。
方法:CRISPR/Cas9双质粒系统,先导入表达pCas的质粒,诱导表达后同时电转表达sgRNA的质粒及同源臂(同源臂长度1400bp),进行同源重组。电转条件:1.8 kv,25uF,200Ω
遇到的问题:(1)电转涂双抗板菌株不长(用低盐和含葡萄糖培养基有菌株生长,但还是特别少);
(2)涂板后第二天做菌检,PCR条带很亮显示敲除(外部引物变短,内部引物扩增不出来),但是!!我想转接出来再做其他实验的时候,条带变得特别弱,和阴性条带一样甚至更弱,推测是质粒丢失。我再去取涂板的单克隆扩增,也都难扩增出来 → 我想过是质粒丢失,但查文献是有比例的,应该不会像我这样都没有吧(用基因组引物确认过,也用16S验证过,是志贺氏菌)
另外:我也用刚果红培养基确认过,敲除mxi后菌落颜色都变白,不像WT那么红。我以为是应该在30℃培养,但文献中只有电转后是30℃复苏及涂板后培养,之后的实验也都是37℃,我37℃和30℃用刚果红培养的敲除株也都是白色,我还是不太相信之前没有丢失,放在4℃冰箱一两天就丢失了........
做了两个月了,快被折磨死了,想请大佬们传授一下经验o(╥﹏╥)o