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MRD 检测是否有必要做、怎么做?从临床研究到诊疗应用

发布于 2024-08-27 · 浏览 1553 · IP 浙江浙江

近些年,从大量的队列研究到一个个的真实的临床案例,MRD 检测显示了其在肿瘤全病程管理中的价值,通过 MRD 检测结果指导的临床诊疗方案,对患者的治疗周期、治疗策略进行精准的划分和指导,从而可以提高患者的治疗预后和生活质量。

MRD 检测价值 — 临床研究

预后分析

在实体瘤领域,通过检测肿瘤释放到血液中的循环肿瘤 DNA(ctDNA),来判断体内是否存在微小残留病灶,可以帮助医生更准确地评估患者的预后情况。

2024 年 5 月 1 日,JCO Precision Oncology 发表了 EBLIS 研究长达 12 年的最终随访结果,也是迄今为止规模最大、ctDNA随访时间最长的乳腺癌MRD队列研究[1]。该研究共纳入 188 例早期乳腺癌患者,156 例接受了完整的 ctDNA-MRD 检测分析及长达 12 年的随访(每半年抽血进行一次MRD检测,共 1,136 份血浆样本)。结果证实:在 ctDNA-MRD 阳性患者的无复发生存期(RFS)和总生存期(OS)均明显较差(HR 分别为 52.98 和 53.69)。

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复发预测

传统术后随访以影像学及肿瘤标志物检测为主,但是无法及时准确的检测到残存的癌细胞,而基于 ctDNA MRD 检测可以早于传统的临床或影像学方法鉴定出疾病复发,以提供提前干预的机会。

同 EBLIS 研究显示,ctDNA MRD 检测的复发时间相比影像学可提前 10.5 个月提示复发风险[1],最早可提前 38 个月(中位 10.5 个月,0~38 个月)。

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疗效预测

治疗期间通过 ctDNA 的定量分析,评估当前治疗的效果,可以为继续治疗或用药方案的选择提供指导。若 ctDNA 下降或清零预示临床治疗获益,ctDNA 上升或复阳提示治疗效果不佳。

在 CALIBRATE-LC/EC-CRT 研究 MRD 预测局晚期 NSCLC 放化疗疗效显示,ctDNA 状态与预后高度吻合[2]。ctDNA 阴性患者的 PFS 显著高于阳性患者。

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药物假期

ctDNA MRD 指导的药物假期策略,有助于减轻患者的经济负担,减少患者用药的毒副作用,延迟耐药时间并改善生存质量。

2024 年 6 月 13 日,吴一龙教授团队开展「ctDNA-MRD 与药物假期」研究(NCT03046316)发表在《JAMA Oncology》杂志。研究表明,对于靶向和局部巩固治疗后实现完全缓解(CR)的晚期 NSCLC 患者,原本的连续用药模式可以转变为密切监测下的间断用药模式,为评估接受 TKI 和 LCT 后晚期 NSCLC 患者是否需要停药提供了重要依据[3]

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MRD 检测——诊疗应用

目前,针对 MRD 应用场景,2023 年 Nature 上发表的 Practical recommendations for using ctDNA in clinical decision making 从 ctDNA 临床应用场景;ctDNA 指导早期肿瘤临床决策;ctDNA 指导免疫治疗临床决策,三个方向阐述了如何在诊疗过程中选择使用 ctDNA 检测分析及 ctDNA 在临床决策的实用性提供概括性建议[4]

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而在 ctDNA MRD NGS 在实际的临床应用中,依然存在两个局限性即成本和准确性。

检测部分成本来源(肿瘤已知分析策略):① 初期的全外显子检测以及筛选监测位点;② 定制个体化 MRD Panel;③ 术后动态监测。使用全外显子初筛检测到的信息,不仅可以对靶向治疗、免疫治疗以及化疗疗效等起到一定的指导作用,同时可以获得足够的变异位点信息,作为个体 MRD Panel 的备选位点。全显子检测不论价格、成熟度、稳定性来说均较为公开和具体。但是在个体化 MRD Panel 检测部分,个体化定制的费用和选择多少位点去做探针/引物的 Panel 定制具有较强的关联性,因此目前的 MRD 检测产品一般将定制化位点控制在一个相对较低的数量下。但是控制成本的同时,准确性是否可以得到保障?

是否有方案可以在兼顾到成本和准确度,让患者更愿意接受 MRD 检测从中获益哪?

答案是增加个体化 MRD Panel 检测位点,以此提高检测灵敏度,减少抽血量(详情可见:MRD 检测可以既少抽血又保证结果准确吗?)。同时,为了控制位点增加带来的定制费用的增加,艾吉泰康基于十年的捕获定制优势,推出个体化 MRD Panel 可达 150 根探针免费定制方案,可最大可能保留患者筛选到的所有体细胞位点。除此之外,开发端对端在线设计平台,实现提交位点、在线设计、下单合成及进度追踪快速流转,确保每个 MRD Panel 可以准确、快速交付。

全流程试剂方案搭配,关注每个环节使用的便利性、稳定性、性价比

在 Tumor-informed 检测策略下,从全外初筛的检测到个体化 MRD Panel 定制及后续动态监测,艾吉泰康已经形成了全方位,全流程的试剂解决方案,包括高效提取试剂盒、建库试剂盒(搭配 UMI 接头)、杂交捕获试剂以及生信分析流程。

多批次标准品测试,个体化定制 Panel 一次成型

1、多位点个体化 MRD Panel 数据表现及稳定性测试

分别使用批间合成的 24 根探针以及不同区域的 150 根探针的 Panel 进行捕获性能测试,实测数据表明,不同探针条数的小 Panel、不同目标区域均可获得稳定、优异的捕获性能。

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图 1. 不同批次合成探针对 cfDNA 标准品捕获表现。使用水木济衡 cfDNA 标准品(MD080719)对两个批次合成的 24 根探针 Panel 捕获性能进行测试。

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图 2. 随机选择 4 个不同目标位点 150 根探针的 MRD Panel 进行捕获性能测试。

2、多位点个体化 MRD Panel 检测灵敏度测试

内部通过使用 8 个和 24 个已知阳性位点的两种 cfDNA 标准品进行批间和批内测试,搭配全流程配套建库捕获试剂以及生信分析流程,位点检出率及稳定性均处于较高水平。同时,此批次实测数据也可看出,检测位点增加,在样本投入量减少的情况下,检出率也可得到提升。

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图 3. 在 0.001%~0.1% 突变频率下,8 个阳性标准品已知突变位点的检出统计。使用突变频率为 0.1% 、0.01%、 0.001% 的 Horizon ctDNA 标准品(HD780)进行 30、50 ng 投入量下建库,随机使用一个 37 根探针的 MRD Panel 进行捕获,下机数据使用艾吉泰康®搭建的 UMI 流程分析,统计单端校正后突变检出数量。

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图 4. 在 0.005%~0.5% 突变频率下,2 个合成批次探针对 24 个阳性标准品已知突变位点的检出统计。使用突变频率为 0.5% 、0.05%、 0.005% 的 水木济衡标准品(MD080719)进行 10、30、50 ng 投入量下建库,随机两个批次合成的 24 根探针的 MRD Panel 进行捕获,下机数据使用艾吉泰康®搭建的 UMI 流程分析,统计单端校正后突变检出数量。

小结

1、ctDNA MRD 检测在预后分析、复发、疗效预测及药物假期存在显著的临床应用价值。

2、ctDNA MRD 可用于指导肿瘤早期临床决策以及免疫治疗方案。

3、艾吉泰康推出 150 根探针 MRD 免费定制方案,结合自主研发的全流程高分子回收试剂,帮助检测过程中实现更少的抽血量、更低的价格,更灵敏的检测 ctDNA 分子。

期待将来有更多的临床研究可以解答 MRD 运用的实际问题,同时降低患者接受检测的经济负担,让新的技术可以更好地造福更多患者。

✩ 本文仅供医疗卫生等专业人士参考

内容策划:邹礼平

内容审核:钟可可

题图来源:图虫创意


参考文献

[1]、Jacqueline A, Shaw,Karen, Page,Evie, Wren et al. Serial Postoperative Circulating Tumor DNA Assessment Has Strong Prognostic Value During Long-Term Follow-Up in Patients With Breast Cancer.[J] .JCO Precis Oncol, 2024, 8: 0.

[2]、Yin, Yang,Tao, Zhang,Jingbo, Wang et al. The clinical utility of dynamic ctDNA monitoring in inoperable localized NSCLC patients.[J] .Mol Cancer, 2022, 21: 0.

[3]、Song, Dong,Zhen, Wang,Jia-Tao, Zhang et al. Circulating Tumor DNA-Guided De-Escalation Targeted Therapy for Advanced Non-Small Cell Lung Cancer: A Nonrandomized Controlled Trial.[J] .JAMA Oncol, 2024, 10: 0.

[4]、Stacey A, Cohen,Minetta C, Liu,Alexey, Aleshin,Practical recommendations for using ctDNA in clinical decision making.[J] .Nature, 2023, 619: 0.

最后编辑于 2024-08-27 · 浏览 1553

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