通过核小体阅读器的蛋白质组剖析解码染色质状态

2024年3月6日《Nature》发表一项研究：DNA 和组蛋白修饰组合成特征模式，划分出基因组的功能区。虽然人们已经描述了许多单个修饰的 "阅读器 "，但如何解释由复合修饰特征、组蛋白变异和核小体间连接DNA组成的染色质状态却是一个重大的未决问题。在这里，我们采用多维蛋白质组学策略，系统地研究了约 2000 个核蛋白与代表启动子、增强子和异染色质状态的 80 多个修饰二核小体之间的相互作用。通过将复杂的核糖体结合图谱解构为共调控蛋白网络和驱动蛋白招募或排斥的独特核糖体特征，我们全面展示了染色质阅读器是如何解码染色质状态的。我们发现不同特征的结合反应非常不同，许多因子能识别多种特征，核糖体修饰和连接子DNA在调控蛋白质与染色质的结合方面基本上是独立运作的。我们的在线资源 "染色质状态调控修饰图谱"（MARCS）提供了深入的分析工具，可帮助我们了解研究结果，推动发现染色质状态调控基因组的基本原理。