时间分辨的单细胞转录组学确定胶质母细胞瘤的免疫轨迹

2023年12月13日《Cell》发表一项研究：破译免疫适应过程中的细胞状态转变是推动生物学发展的基础。目前还缺乏捕捉细胞动态的经验性体内基因组技术。我们介绍的 Zman-seq 是一种记录跨时间转录组动态的单细胞技术，它将时间戳引入循环免疫细胞，并在组织中对其进行长达数天的追踪。应用 Zman-seq 技术解析了胶质母细胞瘤免疫微环境失调的细胞状态和分子轨迹。在肿瘤浸润的 24 小时内，细胞毒性自然杀伤细胞过渡到由 TGFB1 信号调控的功能失调程序。浸润的单核细胞在36至48小时内分化为免疫抑制巨噬细胞，其特征是抑制性髓系检查点Trem2、Il18bp和Arg1的上调。使用拮抗剂抗-TREM2 抗体治疗后，单核细胞轨迹重定向至促炎症巨噬细胞，从而重塑了肿瘤微环境。Zman-seq 是一种广泛适用的技术，能对分化轨迹进行实证测量，从而促进更有效的免疫疗法的开发。