转录启动的结构可视化作用

2023年12月22日《Science》发表一项研究：转录起始是一个复杂的过程，其机制尚不完全清楚。我们测定了新生 RNA 长度达到 2 至 17 个核苷酸时，RNA 聚合酶 II 在无 G 启动子上停止的新生转录复合物 TC2 至 TC17 的结构。将这些结构连接起来，就生成了一部电影和一个工作模型。随着最初合成的 RNA 的增长，一般转录因子（GTF）仍与启动子结合，转录泡扩大。三磷酸核苷（NTP）驱动的 RNA-DNA 易位和模板链在几乎密封的通道中的积累可能会促进初始转录复合物（ITC）（TC2 至 TC9）向早期延伸复合物（EEC）（TC10 至 TC17）的过渡。我们的研究显示了转录起始的动态过程，并揭示了为什么 ITCs 需要 GTF 和气泡扩张来进行初始 RNA 合成，而 EECs 则需要 GTF 从启动子解离和气泡塌陷来实现启动子逃逸。