IKAROS 在多个尺度上组装了特定品系的三维基因组结构

2023年11月22日《Cell》发表一项研究：由粘合素和 CTCF 相互作用产生的一般水平的染色质组织足以限制调控元件之间的杂乱相互作用，但要配置基因组以引导基因表达变化，从而推动正确的品系演变，则需要取代这些限制的品系特异性染色质组装。在 B 细胞前体中进行的功能缺失研究表明，IKAROS 在为淋巴细胞发育做准备的过程中组装了跨越巨碱基距离的相互作用。来自与 IKAROS 结合的增强子的相互作用超越了 CTCF 强加的界限，从而在较小的不变拓扑结构域的主干上建立起特定于系的调控单元。IKAROS在上皮细胞中的功能增强证实了IKAROS在多个尺度上重构染色质结构的能力。虽然基因组编辑所需的Igκ基因座的紧束状态是IKAROS在淋巴细胞中独有的功能，但其更普遍的功能是预配置基因组，以支持特定品系的基因表达并抑制品系外基因的激活，这为品系限制提供了一个范例。