文献解析 | 看干细胞肝癌免疫功能，如何拿下6分+！

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大家好，本期小编分享一篇题为Hypoxic Chara cteri stic in the Immun osup pressive Micro enviro nment of Hepa toce llular Carc inoma（肝癌免疫抑制微环境中的缺氧特性）的研究论文。

研究背景

通常，肝细胞癌（HCC）存在于促进肿瘤逃逸的免疫抑制微环境中。缺氧会影响肿瘤微环境中的细胞间串扰。本研究旨在探讨和阐明肝细胞癌患者缺氧与免疫治疗的潜在关系。

HCC基因组和临床病理学数据集来自癌症基因组图谱（TCGA-LIHC），基因表达综合数据库（GSE14520）和国际癌症基因组联盟（ICGC-LIRI）。TCGA-LIHC病例基于单样本基因集富集分析和分层聚类划分为聚类。

在鉴定不同缺氧条件下的免疫抑制微环境患者后，研究了免疫学特征与缺氧集群之间的相关性。随后，通过差异表达、单变量Cox回归和套索回归分析建立缺氧相关评分。

通过生存和受试者工作特征曲线分析验证了该评分。GSE14520队列用于验证免疫细胞浸润和免疫检查点表达的结果，而ICGC-LIRI队列用于验证缺氧相关评分。

见图一

研究流程图。

图一

见图二

免疫相关集群的识别和验证。

图二

（A） 免疫激活（红色）和免疫抑制（蓝色）集群的分层聚类。树形图中的每个分支代表 LIHC 队列中的一个案例。

（B）免疫相关集群的热图，ssGSEA结果和ESTIMATE分数。

（C-E）T细胞抑制剂（C）、主要组织相容性复合体（D）和T细胞刺激因子（E）在每个簇中的表达。

 见图三

免疫抑制簇中缺氧相关簇的鉴定和验证。*P < 0.05，**P < 0.01，****P < 0.001。

图三

（A）缺氧（橙色）和非缺氧（绿色）患者的分层聚类。（B，C）基于MCP计数器（B）和TIMER2.0（C）方法的缺氧相关簇中的免疫细胞浸润。

（D）每个簇中的免疫检查点基因表达。

见图四

差异表达基因的缺氧相关特征。

图四

（A）火山图的构建和验证。

（B）差异表达基因的单变量Cox回归分析。

（C） 套索回归的部分似然偏差。

（D）套索回归分析。

（E） 所包含基因的系数。（法，八）基于TCGA队列和ICGC队列的生存分析。

见图五

缺氧相关评分的热图。

图五

*P < 0.05，**P < 0.01，****P < 0.001。一些结局的单位如下：AFP（ug/L）、凝血酶原时间（秒）和白蛋白（g/dL）。

见图六

缺氧相关评分 。

图六

（A，B） 的 ROC 和 Cox 回归分析 基于 TCGA 队列的 3 （A） 和 5 （B） 年缺氧相关评分的 ROC 分析。

（C，D）基于ICGC队列在3（C）和5（D）年时对缺氧相关评分的ROC分析。

（E）单变量Cox回归分析。

（F）多变量Cox回归分析。“T”代表肿瘤大小，“M”代表距离转移，“N”代表淋巴结转移。

见图七

在GEO队列中识别免疫相关集群。

图七

（A）免疫激活（红色）和免疫抑制（蓝色）集群的分层聚类。树形图中的每个分支代表 GSE14520 队列中的一个案例。

（B）免疫相关集群的热图，ssGSEA结果和ESTIMATE分数。

见图八

GEO队列中缺氧相关集群的识别和验证。

图八

（A-C）T细胞抑制剂（A）、主要组织相容性复合物（B）和T细胞刺激物（C）在每个免疫相关簇中的表达。

（D）缺氧（橙色）和非缺氧（绿色）聚类的分层聚类树。

（E）使用MCP计数器方法在每个缺氧相关簇中进行免疫细胞浸润。

（F）缺氧相关簇中的免疫检查点基因表达。

研究结论

总之，我们的研究说明了缺氧在免疫抑制性肝细胞癌患者中的关键作用。定义的缺氧相关亚型可能有助于揭示缺氧与免疫抑制微环境之间的调节机制，其相关评分对未来的预测模型具有潜在意义。

好了，今天的文献解读就到这儿来，我们下期再见！