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纯生信文章已从Frontiers期刊撤下,但是还想分享一下两次投稿经验

胃肠病学医学生 · 最后编辑于 2023-06-12 · IP 浙江浙江
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这个帖子发布于 2 年零 51 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。

本人和队友共同完成了一篇肿瘤纯生信文章,先后两次投稿F旗下期刊

第一次是F基因学 FIG

第二次是F免疫学 FII

目前因文章质量原因,从F免疫学撤下,进行了大幅修改,找其他出版社期刊投稿

此前有一篇Hindawi 国际肿瘤学学刊 JOO 投稿的经验,中等程度修改后,一次变通过

不过由于出版社的原因,这本期刊不算是SCI了。。。

不过我还是有其他参与作图的SCI或SSCI文章见刊滴。。。


分享一下自己两次投稿F的经验,还有从网友获取的信息,帮助大家更好地了解F期刊投稿


首先第一次投稿F基因学

审稿人给出的评分较为可观,特别是严谨性评分给到了4/5分

但提出验证集AUC低于0.7,验证不算成功,

其次应当论证亚组也有很好的预测价值

此外要求补充生物学实验,但比较宽容,表示哪怕只用细胞系实验也行

收到审稿意见后,我立刻根据审稿人的观点补充了三四块生信的代码

队友则跟导师想办法解决实验方面的问题


同时F基因学期刊因找不到第二个审稿人对这篇文章拒稿


但实验的问题一直没有得到解决,于是又以纯生信文章投稿至F肿瘤


这次为了避免第一次审稿人不足的问题,队友填写了邀请的审稿人(本科学校的教授等)


第一位、第二位审稿人主要说我们建模与前人相似的生信研究重复,并列出了文献的PMID,要求作者解释

此外要求作者增加免疫疗法预测相关内容

第三位审稿人学生帮忙审稿,表面给过,但是私下听说这个学生(因为是队友的本科校友,所以间接听别人说了)嘲笑我做的图都是某学网的代码抄一抄(没有创新)

第四位审稿人基本认可我们研究的创新性

不过4位审稿人都要求我们补生物学实验


由于第三位审稿人私下表达意见是先通过本科校友打听到的,是最先知道的

听到他说我的代码都是抄来的,我被气得夜不能寐

我的队友在说这件事的时候还“哈哈哈”

我就纳闷了,这篇文章的第一作者,不是他么?

审稿人笑话我的图,不也是笑话他么?。。。


考虑到第一、二位审稿人创新型不足的问题,完成了重新建模、

队友还跟我说,我除了原则性错误,不要修改配色、增加算法等

因为第三位审稿人已经表明会给我们过

我没理他,重新找到GO等富集分析基因集中的相关通路的基因

重新构建模型,修改hub基因

把作图的思路全部推翻,一点一点抠细节,对图片各种美化

重新建模后要求队友配合,进行严格的“科技查新”工作,不能再出现大量marker重复的情况

已经确认没有这方面的问题

免疫疗法预测相关内容已经通过生信数据库增加


由于实验进展缓慢,以及第一位、第二位审稿人的意见可以说非常致命

而且F期刊的主编 副主编权限很大,在任何阶段他们都会拒稿

哪怕最后几位审稿人当中,同意者>反对者,也都有可能拒稿

所以虽然4位审稿人没有明确说拒稿,但还是要求队友从期刊上撤下


验证的实验在撤下稿件后全部完成,

然后我又用R语言对hub基因和内参基因进行处理,并进行了t检验分析的可视化

队友负责选刊和投稿


最近在别的平台(某乎)上收到网友咨询,知悉有的审稿人会要求作者对LASSO等机器学习的调节超参过程进行说明

我吓得立马打开了R项目,把LASSO-Cox和SVM-RFE的流程使用mlr3包进行处理,增加了调参的内容

以防后续投稿被审稿人提问


通过两次在F出版社的投稿,本人最大的收获是:

如果期刊不是强制要求邀请审稿人,建议不要在投稿系统后台填写相关内容

因为沾亲带故的人“帮忙”反而更麻烦

甚至还不如随机分配、完全不认识的审稿人

做实验队友导师一开始也希望病理科的老师能帮忙,也没帮咱们

所以简单而言:关系没用


其次审稿人叫你干嘛你就干嘛

说你哪不行就认真改

哪怕得重新建模也要认真修改

别跟我队友一样,跟审稿人犟嘴


虽然现在的投稿到其他出版社,

还是好几次因选题不符被拒,

但是出版社专门推荐了同出版社的其他SCI期刊

这说明文章本身是有质量的

其他有相似遭遇的亲可以不用心慌,

因为跟直接拒稿没有推荐的文章比起来,我们的文章以后被录用的概率还是更大一些的


F期刊还有坑爹的操作是已经确认接收和收到版面费后,还会建议转投

某985网友投稿F旗下的N期刊后,已经基本上都确认了,他钱也交了

谁知道2个月后出版社询问其是否愿意转投F旗下的O期刊

F旗下的O期刊也是一本SCI

但这所985认为F旗下的O期刊是预警,不计入为科研成果

所以他导师和他都非常的生气

我说F出版社这么做是非常没有契约精神的表现,赶紧撤了,要回版面费,以挽回损失

之前有人在Hindawi投稿缴费后,发现出版社暴雷,立刻索要回了版面费,应该能要回来

F出版社收钱建议转投的事情,丁香园也看到其他人发帖

说明这样的事情他们经常干


以上就是我的投稿经验分享

感谢大家的阅读

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