基因预测是不是转录因子?
Q:真菌中有一个基因定位在细胞核,但是不知道是不是转录因子,想要预测一下,网上参考了几个网站,JASPAR等,但是具体不知道该怎么预测,请问有大神预测过转录因子么?
A1:常用的就是JASPAR,打开JASPAR,把你需要预测基因直接输进去,出现Motif的就是转录因子,啥都没有的就不是。不过JASPAR中的转录因子并不全。还可以去NCBI-gene 输入你的基因,会有对这个基因的描述
A2:转录因子结合位点序列具有保守性,通常为一段6~12bp的DNA序列,最多不超过20bp。可以通过验证这段特异性序列来预测转录因子,或者上jaspar网站上预测一下保守序列
Q:牛奶中的8个蛋白,异源表达出来如果纯化出来怎么测活性啊,而且有些蛋白能还有一些保健特性,如果要做成产品的话该怎么做(有没有食品的同仁解答)
A1:有些蛋白会有专门的活性检测试剂盒。
Q:灭活血清的时候有其他事情忘掉血清还在灭活了,现在灭活了十个小时,还能用吗?
A1:灭活时间过长,会造成血清品质下降,影响实验结果
A2:不建议用了,灭活10小时活性肯定衰减了
Q:之前测的elisa,我用LPS和干扰素伽马诱导巨噬细胞3小时,然后换液培养48小时,还有给药组,结果elisa测出来LPS组的白介素10水平最高,不知道什么原因,求大神指点
A1:考虑是干扰素伽马的浓度不够,所以elisa测得白介素组是lps的高,建议提高干扰素诱导浓度后再做elisa
Q:养了一批大肠杆菌,想要获得外膜蛋白。不走基因合成路线,有什么好方法吗各位?
A1:分离细菌外膜蛋白的方法:
① 于20ml 营养肉汤中过夜培养细菌,37℃,200rpm。
② 10000g、20min、4℃离心,去上清。
③ 20ml预冷的Tris-Mg缓冲液重悬,同样条件离心,再重悬于预冷的Tris-Mg缓冲液。
④ 超声波破碎细菌。
⑤ 3000g,10min、室温下离心去除未破碎细菌。小心吸取上清(含有胞质成分和细菌外被成分)。
⑥ 超速离心I:100,000g,60min,4℃,去除上清(胞质成分),收集细菌外被成分。
⑦ 用10ml含2%的SLS的Tris-Mg 缓冲液重悬沉淀物,室温温育20-30min。
⑧ 超速离心II:70,000g,60min,室温沉淀收集外膜蛋白,去除上清(含细胞质膜)。重复⑦、⑧两步。
⑨ 充分吸除上清,并根据沉淀体积大小用0.1-0.2 ml的ddH2O重悬沉淀物。根据公式:蛋白浓度(mg/ml)=1.450 D280-0.740 D260测定外膜蛋白浓度,调节蛋白浓度至40ug/ul,该蛋白质样品-70℃贮存。
A2:可以通过重组表达的方式获得大肠杆菌外膜蛋白 OmpC和OmpF
Q:如何筛出高产蛋白酶的乳酸菌
A1:利用透明圈法筛选出高产蛋白酶的乳酸菌。
A2:使用添加碳酸钙的改良乳酸菌的固体培养基通过单因变量的改变,可以筛选分离得到高蛋白酶活性的乳酸菌种。

丁香实验×安捷伦——细胞实验专场提问活动开始啦!
活动期间,在丁香实验小程序上抛出你的细胞实验问题,就能得到竹节杯、定制雨伞、U 盘等实物奖励,还可获得丁当虚拟奖励,可在丁香商城兑换心仪的礼品哦~
科研提问活动 · 细胞实验专场
活动时间:4 月 18 日~6 月 13 日
主题:细胞实验
(请先发布提问,再填写收货信息)
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Step 1:
👉 方式一:直接进入丁香实验小程序,点击底部【我要提问】,提出你的细胞问题,关联细胞提问活动,即可。
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最后编辑于 2023-06-01 · 浏览 818